การประเมินประสิทธิภาพของเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ในการหาความสัมพันธ์พ่อแม่ลูกในสุกร

Abstract

การศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อ ประเมินประสิทธิภาพของเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ในการหาความสัมพันธ์พ่อ แม่ ลูก จากตัวอย่างดีเอ็นเอของสุกรจำนวน 80 ตัวอย่าง โดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์จำนวน 16 ตำแหน่ง ได้แก่ D00768, KVL9000, NLRIP0001, S0663, S0710, S0719, S0766, SJ859, SJ923, SJ924, SJ925, SJ926, SJ927, SJ929, X53085 และ X63893 ทำการเพิ่มจำนวนชิ้นส่วนดีเอ็นเอด้วยวิธี polymerase chain reaction (PCR) จากนั้นวิเคราะห์ผลผลิต PCR ด้วยวิธี agarose และ polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) ผลการศึกษาพบว่า สามารถเพิ่มจำนวนชิ้นส่วน ดีเอ็นเอได้จำนวน 15 ตำแหน่ง ยกเว้นตำแหน่ง SJ925 ทำการคัดเลือกเครื่องหมายพันธุกรรมไม โครแซทเทลไลท์ที่เหมาะสมในการศึกษาครั้งนี้ได้ทั้งสิ้นจำนวน 7 ตำแหน่ง ได้แก่ S0663, D00768, KVL9000, S0719, NLRIP0001, S0766 และ S0710 ซึ่งตรวจพบจำนวนอัลลีลอยู่ระหว่าง 4 - 8 อัลลีล นอกจากนี้จากการคำนวณค่า observed และ expected heterozygosity พบว่ามีค่า 0.3250-1.0000 และ 0.5456-0.8302 ตามลำดับ ค่า polymorphic information content (PIC) มีค่า 0.5179-0.8106 และ ค่าความแม่นยำในการวิเคราะห์ผลเมื่อนำเครื่องหมายไปใช้งานร่วมกัน (combined exclusion probability; CEP) มีค่าเท่ากับ 99.46 เปอร์เซ็นต์ ในการศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นว่าเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ทั้ง 7 ตำแหน่ง มีประสิทธิภาพในการใช้งานสูง และสามารถใช้เป็นเครื่องมือสำหรับตรวจสอบความสัมพันธ์พ่อ แม่ ลูกของสุกรในประเทศไทยได้ดี