Please use this identifier to cite or link to this item:
https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/43515
| Title: | ระบาดวิทยาและจัดจำแนกสายพันธุ์ระดับโมเลกุลของเชื้อไวรัสโคโรนาที่มี การติดเชื้อในผู้ป่วยไทยช่วงปี ค.ศ. 2012-2013 |
| Other Titles: | MOLECULAR EPIDEMIOLOGY AND CHARACTERIZATION OF HUMAN CORONAVIRUS IN THAI PATIENTS DURING 2012-2013 |
| Authors: | รพีพรรณ สูณรงค์ |
| Advisors: | ยง ภู่วรวรรณ สัญชัย พยุงภร |
| Other author: | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะแพทยศาสตร์ |
| Advisor's Email: | yong.p@chula.ac.th Sunchai.P@chula.ac.th |
| Subjects: | การติดเชื้อไวรัสโคโรนา ทางเดินหายใจ -- โรค Coronavirus infections Respiratory organs -- Diseases |
| Issue Date: | 2556 |
| Publisher: | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย |
| Abstract: | เชื้อไวรัสโคโรนาเป็นสาเหตุทำให้เกิดการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจในคน งานวิจัยนี้ได้ศึกษาระบาดวิทยาเชิงโมเลกุลและจัดจำแนกสายพันธุ์ระดับโมเลกุลของเชื้อไวรัสโคโรนาที่มีการติดเชื้อในผู้ป่วยไทยช่วงเดือนมกราคม 2555 ถึงเดือนธันวาคม 2556 จากตัวอย่างน้ำล้างโพรงจมูกและสารคัดหลั่งจากโพรงจมูกจำนวนทั้งหมด 5,833 ตัวอย่าง จากโรงพยาบาลในกรุงเทพมหานคร จังหวัดขอนแก่นและจังหวัดชลบุรี ด้วยวิธี Polymerase chain reaction (PCR) ด้วยการวิเคราะห์ที่บริเวณยีน RNA-dependent RNA polymearse (RdRp) ให้ผลบวกต่อเชื้อไวรัสโคโรน่า 0.79% (46/5,833) ในกลุ่มประชากรที่ศึกษาเด็กอายุ 0-5 ปี มีอัตราการติดเชื้อไวรัสโคโรนามากที่สุด 54.35% (25/46) โดยอัตราส่วนของเพศหญิงต่อเพศชายเท่ากับ 1:1.08 การติดเชื้อไวรัสโคโรน่าสามารถพบได้ตลอดทั้งปี แต่จะพบการติดเชื้อได้สูงในฤดูฝนช่วงเดือนพฤษภาคมถึงเดือนตุลาคม นอกจากนี้เมื่อนำตัวอย่างที่ให้บวกต่อไวรัสโคโรนามาทำการจัดจำแนกสายพันธุ์ด้วยการวิเคราะห์ที่บริเวณยีนSpike ด้วยวิธี PCR เพื่อสร้าง phylogenetic tree จัดจำแนก HCoV ที่ศึกษาในครั้งนี้ออกได้เป็น 4 สายพันธุ์ คือ HCoV-229E 10.87% (5/46), HCoV-OC43 6.52% (3/46), HCoV-NL63 41.30% (19/46) และ HCoV-HKU1 41.30% (19/46) การศึกษาโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนาในประชากรไทยในช่วงปี 2555-2556 จะเป็นข้อมูลที่เป็นประโยชน์ในการศึกษาเฝ้าระวังป้องกันการติดเชื้อไวรัสโคโรนาสายพันธุ์อื่นๆ ในประชากรไทย |
| Other Abstract: | Global emergence of coronaviruses causes respiratory infections in humans. This study investigated the prevalence of HCoV infection in Thai patients for two year from January 2012 to December 2013. In total, 5,833 clinical samples from nasopharyngeal swab/aspirate were collected from Bangkok, Khon Kaen and Chon Buri. Analysis of the rate of infections was performed using PCR and sequence analysis of the viral RNA-dependent RNA polymerase gene (RdRp). HCoV infection was found in 0.79% (46/5,833) of the total samples. Out of all population subsets, HCoV was detected mainly in young patients between the ages of 0 –5 years (25/46). Amongst the positive cases, 56.52% were male and 43.48% were female (1.08:1). During for the two-year period this study HCoV infection occurred throughout the year, although HCoV infection peaked from May to October, which coincided with the rainy season. Moreover, 46 of HCoV positive samples clustered into four genotypes. To assess the relationship among the strains identified, phylogenetic trees were constructed based on the alignment analysis of the HCoV spike gene sequencesobtained from PCR. These are HCoV-229E 10.87% (5/46), HCoV-OC43 6.52% (3/46), HCoV-NL63 41.30% (19/46) and HCoV-HKU1 41.30% (19/46). This study thus provides the HCoV infection rate in a Thai cohort from 2012 to 2013. These data may also be useful in modeling other types of coronavirus infection in the Thai population. |
| Description: | วิทยานิพนธ์ (วท.ม.)--จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย, 2556 |
| Degree Name: | วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต |
| Degree Level: | ปริญญาโท |
| Degree Discipline: | ชีวเคมีทางการแพทย์ |
| URI: | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/43515 |
| URI: | http://doi.org/10.14457/CU.the.2013.960 |
| metadata.dc.identifier.DOI: | 10.14457/CU.the.2013.960 |
| Type: | Thesis |
| Appears in Collections: | Med - Theses |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| 5574205430.pdf | 3.83 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.