Please use this identifier to cite or link to this item:
https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/55891
Title: | Purification and characterization of glucoamylase from endophytic fungus EF6 |
Other Titles: | การทำให้บริสุทธิ์และลักษณะเฉพาะของกลูโคแอมีเลสจากราเอนโดไฟต์สายพันธุ์ EF6 |
Authors: | Patcharaporn Tangngamsakul |
Advisors: | Polkit Sangvanich Prakitsin Sihanonth |
Other author: | Chulalongkorn University. Faculty of Science |
Advisor's Email: | Polkit.S@Chula.ac.th Prakitsin.S@Chula.ac.th |
Subjects: | Endophytic fungi Amylases Amylases -- Identification Amylases -- Purification เชื้อราเอนโดไฟต์ อะมีเลส อะมีเลส -- การพิสูจน์เอกลักษณ์ อะมีเลส -- การทำให้บริสุทธิ์ |
Issue Date: | 2006 |
Publisher: | Chulalongkorn University |
Abstract: | Selective 25 endophytic fungi from stock culture of RCBC found that EF6 has maximum amylase activity was obtained after 8 days of incubation. Amylase from EF6 was extracted with 90% (NH[subscript 4])[subscript 2]SO[subscript 4] and purified by ion exchange chromatography using Q sepharose and gel filtration using Superdex75, respectively. The purity of amylase was 14.93 fold over the original culture filtrate with a 10.93% recovery activity. The estimated molecular mass of purified amylase is about 62 kDa. Optimum conditions for this amylase are 50-60 degree celsius, pH 5.0-6.0. Amylase still functions with the temperature below 60 degree celsius. At this point the activity was decreased to 43%. The activity of this enzyme can be increased with the present of Ba[superscript 2+] , Ca[superscript 2+] and Mg[superscript 2+] whereas AI[superscript 3+] , Ag[superscript 2+] and Cu[superscript 2+] acted as enzyme inhibitors. For various type of starch, tapioca starch is the easiest material for the digestion process. The K[subscript m] and V[subscript max] value were 2.63 mg and 1.25 mM/min, respectively. The purified amylase was indentified by mass spectrometry. The result shown that purified amylase may be glucoamylase (3.2.1.3) because partial amino acid sequences of that enzyme similar to glucoamylase (3.2.1.3) from Amorphotheca resinae. |
Other Abstract: | จากการคัดเลือกราเอนโดไฟต์ทั้งหมด 25 ชนิด จากคลังเชื้อ RCBC พบว่า EF6 สามารถสร้างแอมีเลสได้มากที่สุดภายหลังการบ่มเป็นเวลา 8 วันในอาหารเหลวที่มีแป้งเป็นองค์ประกอบ จากนั้นทำการตกตะกอนโปรตีนด้วย 90% เกลือแอมโมเนียมซัลเฟต และนำไปแยกแอมีเลส ด้วยเทคนิค Ion Exchange Chromatography (Q Sepharose) และ Gel Filtration (Superdex 75) ตามลำดับ แอมีเลสที่ได้มีความ บริสุทธิ์มากขึ้น 14.93 เท่า และมีกิจกรรมของเอนไซม์คิดเป็น 10.93 เปอร์เซ็นต์ เมื่อเทียบกับสารละลายโปรตีนเริ่มต้น โดยเอนไซม์แอมีเลสที่ได้นี้มีมวลโมเลกุลประมาณ 62 กิโลดาลตัน หลังจากนั้นทำการหาสภาวะที่เหมาะสมต่อการทำงานของเอนไซม์พบว่าเอนไซม์แอมีเลสสามารถทำงานได้ดีที่อุณหภูมิระหว่าง 50-60 องศาเซลเซียส และที่ pH 5.0-6.0 นอกจากนี้ความสามารถในการคงตัวของแอมีเลส ภายหลังการบ่มไว้เป็นเวลา 30 นาที พบว่ายังคงสามารถทำงานได้ดีที่อุณหภูมิต่ำกว่า 60 องศาเซลเซียส แต่ที่ 60 องศาเซลเซียส การทำงานของเอนไซม์จะลดลงเหลือ 43 เปอร์เซนต์และยังพบว่าไอออนโลหะมีผลต่อการทำงานของเอนไซม์ซึ่ง Ca[superscript 2+] , Ba[superscript 2+] และ Mg[superscript 2+] จะสามารถกระตุ้น การทำงานของแอมีเลสให้ดีขึ้น ในขณะที่ AI [superscript 3+], Ag[superscript 2+] และ Cu[superscript 2+] จะไปยับยั้งการทำงานของเอนไซม์โดยแป้งมันสำปะหลังจะเป็นวัตถุดิบที่เอนไซม์สามารถย่อยได้ดีที่สุด โดยเอนไซม์มีค่า K[subscript m] และ V[subscript max] เท่ากับ 2.63 mg และ 1.25 mM/min ตามลำดับ จากนั้นนำเอนไซม์ที่ได้ไปพิสูจน์เอกลักษณ์ทาง Mass spectrometry ผลที่ได้พบว่าน่าจะเป็นกลูโคแอมีเลส เนื่องจากมีลำดับกรดอะมิโนบางส่วนคล้ายคลึงกับกลูโคแอมีเลส (3.2.1.3) ที่ได้จาก Amorphotheca resinae |
Description: | Thesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2006 |
Degree Name: | Master of Science |
Degree Level: | Master's Degree |
Degree Discipline: | Biotechnology |
URI: | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/55891 |
URI: | http://doi.org/10.14457/CU.the.2006.1748 |
metadata.dc.identifier.DOI: | 10.14457/CU.the.2006.1748 |
Type: | Thesis |
Appears in Collections: | Sci - Theses |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
patcharaporn_ta_front.pdf | 1.62 MB | Adobe PDF | View/Open | |
patcharaporn_ta_ch1.pdf | 345.22 kB | Adobe PDF | View/Open | |
patcharaporn_ta_ch2.pdf | 2.9 MB | Adobe PDF | View/Open | |
patcharaporn_ta_ch3.pdf | 1.33 MB | Adobe PDF | View/Open | |
patcharaporn_ta_ch4.pdf | 3.02 MB | Adobe PDF | View/Open | |
patcharaporn_ta_ch5.pdf | 340.78 kB | Adobe PDF | View/Open | |
patcharaporn_ta_back.pdf | 5.09 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.