การคำนวณการเข้าจับเชิงโมเลกุลระหว่างอนุพันธ์ของไอโซไนอะซิดกับเอนไซม์ของเชื้อวัณโรคดื้อยา

ศันสนีย์ แก้วมรกต

Please use this identifier to cite or link to this item: https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/66127

Title:	การคำนวณการเข้าจับเชิงโมเลกุลระหว่างอนุพันธ์ของไอโซไนอะซิดกับเอนไซม์ของเชื้อวัณโรคดื้อยา
Other Titles:	Molecular docking calculation between isoniazid derivatives and enzyme of drug-resistant tuberculosis
Authors:	ศันสนีย์ แก้วมรกต
Advisors:	สมศักดิ์ เพียรวณิช
Other author:	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะวิทยาศาสตร์
Advisor's Email:	ไม่มีข้อมูล
Subjects:	วัณโรค การคำนวณการเข้าจับเชิงโมเลกุล
Issue Date:	2560
Publisher:	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
Abstract:	ปัจจุบันเชื้อที่ก่อให้เกิดวัณโรค (เชื้อแบคทีเรีย Mycobacterium tuberculosis) เกิดการดื้อต่อยารักษา การดื้อยาของเชื้อโรคมักจะเกิดจากการที่เอนไซม์เป้าหมายของยารักษาโรคนั้นเกิดการกลายพันธุ์ ทาให้ยาไม่สามารถเข้าจับได้ จึงไม่สามารถยับยั้งการทางานของเอนไซม์นั้นได้ งานวิจัยนี้ศึกษาเปรียบเทียบโครงสร้างการเข้าจับระหว่างอนุพันธ์ของไอโซไนอะซิดจานวน 30 ชนิด กับโครงสร้างของเอนไซม์ 9 โครงสร้าง คือเอนไซม์ของเชื้อวัณโรคชนิดดั้งเดิมและชนิดที่มีการกลายพันธุ์ ได้แก่ I21V, S94A, I47T, D148G, V203A, I215A, T266E และ T266D โดยใช้เทคนิคการคานวณการเข้าจับเชิงโมเลกุล ซึ่งจะเป็นประโยชน์ต่อการค้นคว้าและพัฒนายารักษาโรคตัวใหม่ที่มีประสิทธิภาพ ผลการคานวณพบว่า ความสัมพันธ์ระหว่างค่าพลังงานการเข้าจับกับค่าการออกฤทธิ์ทางชีวภาพของตัวยับยั้งที่เข้าจับกับเอนไซม์ของเชื้อวัณโรคชนิดดั้งเดิมนั้นไม่มีความสอดคล้องกัน และในเอนไซม์ชนิดดั้งเดิม พบว่า วงหลักของอนุพันธ์ไอโซไนอะซิดนั้นเกิดอันตรกิริยากับกรดอะมิโนชนิด Gly96, Phe97 และ Ala198 รวมทั้งเกิดพันธะไฮโดรเจนกับโมเลกุล NADH ที่อยู่ในโครงสร้างของตัวรับเป็นหลัก นอกจากนี้ยังพบว่าอนุพันธ์ของไอโซไนอะซิดส่วนใหญ่สามารถเข้าจับได้ดีกับเอนไซม์ของเชื้อวัณโรคชนิดกลายพันธุ์ V203A, I215A, T266E และ T266D และสุดท้ายพบว่าตัวยับยั้งชนิด 1i, 6i และLL-3858 น่าจะมีประสิทธิภาพในการออกฤทธิ์กับเอนไซม์ชนิดกลายพันธุ์ได้ดี เนื่องจากมีลักษณะการเข้าจับของตัวมันเองในเอนไซม์ชนิดดั้งเดิมคล้ายกับชนิดที่มีการกลายพันธุ์
Other Abstract:	Nowadays, Mycobacterium tuberculosis, which causes tuberculosis, has developed resistance to drug treatment. The resistance is usually caused by mutation in enzyme target, hence drug cannot suitably bind to the enzyme target and thus it cannot inhibit the enzyme function. In this research, molecular docking calculations between 30 isoniazid derivatives and 9 enzyme structures, wild type and 8 mutations, which are I21V, S94A, I47T, D148G, V203A, I215A, T266E and T266D, were carried out and compared. This research will be useful for research and development of new effective drugs. The results show that no relationship between binding energy and biological activity for wild type enzyme could be observed. In the wild type, the core structure of isoniazid derivatives interacts mainly with Gly96, Phe97, and Ala198 and it also form hydrogen bonding with NADH in the enzyme. In addition, most isoniazid derivatives bind well with V203A, I215A, T266E and T266D mutations. Finally, 1i, 6i and LL-3858 inhibitors are possible to inhibit the mutant enzymes as well because they can bind to the wild type and 8 mutants of enzyme with similar binding modes.
Description:	โครงงานเป็นส่วนหนึ่งของการศึกษาตามหลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรบัณฑิต ภาควิชาเคมี คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ปีการศึกษา 2560
URI:	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/66127
Type:	Senior Project
Appears in Collections:	Sci - Senior Projects

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
Sansanee Ka_SE_2560.pdf		2.94 MB	Adobe PDF	View/Open

Show full item record