Please use this identifier to cite or link to this item:
https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/7839
Full metadata record
DC Field | Value | Language |
---|---|---|
dc.contributor.author | อลงกร อมรศิลป์ | - |
dc.contributor.other | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะสัตวแพทยศาสตร์ | - |
dc.coverage.spatial | ไทย | - |
dc.date.accessioned | 2008-08-22T09:27:16Z | - |
dc.date.available | 2008-08-22T09:27:16Z | - |
dc.date.issued | 2548 | - |
dc.identifier.uri | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/7839 | - |
dc.description.abstract | เชื้อไวรัสพี อาร์ อาร์ เอส เป็นเชื้อไวรัสที่เป็นสาเหตุของโรคพี อาร์ อาร์ เอส ในสุกร การวิจัยครั้งนี้เป็นการหาลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัสพี อาร์ อาร์ เอส สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย คือ 01NP1 เชื้อไวรัส 01NP1 นี้มีขนาด 15412 นิวคลีโอไทด์ ซึ่งประกอบด้วย 5’ UTR และ 3’ UTR (บริเวณที่ไม่มีการสร้างโปรตีน) และยีน (ORF) จำนวน 8 ยีน คือ ORF1a ORF1b และ ORF2-7 เพื่อที่จะเปรียบเทียบ ความแตกต่างของรหัสพันธุกรรมและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ของเชื้อไวรัส คณะผู้วิจัยได้เปรียบเทียบลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัสสายพันธุ์ไทยกับเชื้อไวรัสสายพันธุ์จากอเมริกา (7 ตัวอย่าง) และ ยุโรป (1 ตัวอย่าง) ผลการวิจัยพบว่าเชื้อไวรัส 01NP1 มีลำดับเบสเหมือนกับเชื้อไวรัส MLV, VR2332, และ BJ-4 เท่ากับ 99.8%, 99.7% และ 99.7% ตามลำดับ ผลการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการพบว่า เชื้อ 01NP1 มีลักษณะทางพันธุกรรมใกล้เคียงกับเชื้อไวรัส BJ-4, MLV และ VR2332 โดยสรุปอาจกล่าวได้ว่าเชื้อไวรัสสายพันธุ์ไทย (1NP1) อาจมีต้นกำเนิดและมีวิวัฒนาการมาจากเชื้อไวรัสที่ใช้เป็นวัคซีน นอกจากนี้ยังผลการเปรียบเทียบลำดับเบสพบว่าบริเวณ 5’UTR และ 3’ UTR ของเชื้อไวรัส 01NP1 มีการเปลี่ยนแปลงของลำดับเบสไม่มาก โดยบริเวณที่พบว่ามีการเปลี่ยนแปลงของกรดอะมิโนมากที่สุด คือ ORF1a การวิจัยครั้งนี้เป็นรายงานแรกในประเทศไทยที่มีการรายงานลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัสพี อาร์ อาร์ เอส สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย | en |
dc.description.abstractalternative | Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is a causative agent of a disease in swine, Porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS). In this study, the complete nucleotide sequences of a Thai PRRSV (01NP1) was determined. The PRRSV (01NP1) contains 15,412 nucleotides with 2 untranslated regions (5’UTR and 3’ UTR) and 8 open reading frames (ORFs) designated as ORF1a, ORF1b and ORF2-7 . In order to determine the genetic variation and genetic relatedness among PRRSV isolates, the complete nucleotide sequences of 01NP1 was compared with that of 7 US isolates and 1 EU isolate. Our results showed that the 01NP1 genome shares approximately 99.8% nucleotide identity with live vaccine strain (MLV) and 99.7% nucleotide identity with 2 other US isolates, VR2332 and BJ-4. Phylogenetic analysis also showed that the 01NP1 was closely related to BJ-4, MLV and VR2332. These finding suggested that Thai PRRSV (01NP1) may has originated and evolved from vaccine virus of its derivatives. The 5’ UTR and 3’ UTR and all 8 ORFs were very well conserved. However amino acid differences were mostly observed in ORF1a (nonstructural gene). This report is the first report of complete nucleotide sequences of PRRSV in Thailand. | en |
dc.description.sponsorship | ทุนวิจัยกองทุนรัชดาภิเษกสมโภช | en |
dc.format.extent | 1515352 bytes | - |
dc.format.mimetype | application/pdf | - |
dc.language.iso | th | es |
dc.publisher | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย | en |
dc.rights | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย | en |
dc.subject | ไวรัส พี อาร์ อาร์ เอส -- ไทย | en |
dc.title | การหาลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัส พี อาร์ อาร์ เอส สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย : รายงานวิจัย | en |
dc.title.alternative | The complete nucleotide sequence analysis of a Thai Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus (PRRSV) isolate | en |
dc.type | Technical Report | es |
dc.email.author | Alongkorn.A@Chula.ac.th | - |
Appears in Collections: | Vet - Research Reports |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
alongkorn.pdf | 1.48 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.