DSpace Repository

Genetics of antibiotic resistance in campylobacter coli isolated from swine in Thailand

Show simple item record

dc.contributor.advisor Rungtip Chuanchuen
dc.contributor.advisor Alongkorn Amonsin
dc.contributor.author Chanon Ekkapobyotin
dc.contributor.other Chulalongkorn University. Faculty of Veterinary Science
dc.date.accessioned 2010-06-22T01:12:21Z
dc.date.available 2010-06-22T01:12:21Z
dc.date.issued 2007
dc.identifier.uri http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/12940
dc.description Thesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2007 en
dc.description.abstract This study was performed in a total of eighty-three Campylobacter coli strains isolated from swine, of which minimal inhibitory concentrations (MICs) for erythromycin, ciprofloxacin, nalidixic acid and tetracycline were known. All of the isolates were investigated for the presence of tetO and class 1 integrase. Forty-four erythromycin-resistant isolates were tested for mutations in 23S rRNA gene. Sixty isolates resistant to ciprofloxacin and/or nalidixic were examined for mutations in gyrA and gyrB genes. Most of the tetracycline-resistant isolates (97%, 65/67) possessed tet(O). Four isolates (4.8%, 4/83) harbored class 1 integrons and all of them produced a 1,000-bp amplicon in a 5′-3′ conserved sequence PCR directed toward amplification of the gene cassettes. DNA sequencing demonstrated that all four isolates possessed the aminoglycoside resistance gene, aadA9. Most of erythromycin-resistant isolates (77%, 34/44) contained mutations in 23s RNA. Five of point mutations were found, of which the most common type was A2230G (70%, 31/44). For nalidixic acid and/or ciproflocxacin resistant strains, all carried mutations in Quinolone Resistance Determining Region (QRDR) of gyrA and 8.5% (5/60) contained mutations in QRDR of gyrB. The predominant mutation in gyrA was C257T (93%, 56/60) that converted threonine at position 86 to isoleucine. The point mutations in gyrB was A1144C (7%, 4/60) that converted lysine at position 381 to glutamic acid. en
dc.description.abstractalternative ศึกษารูปแบบและพันธุกรรมการดื้อยาของ Campylobacter coli จำนวน 83 เชื้อที่แยกได้จากสุกรที่ทราบค่าความเข้มข้นต่ำสุดของสารต้านจุลชีพ (MICs) สำหรับยาปฏิชีวนะ erythromycin, ciprofloxacin, nalidixic acid และ tetracycline แล้ว ตรวจหาการปรากฏของยีน tetO และ intl1 ในเชื้อทุกตัว ตรวจการกลายพันธุ์ของยีน 23S rRNA ในเชื้อที่ดื้อต่อยา erythromycin จำนวน 44 ตัว และตรวจการกลายพันธุ์ในส่วน Quinolone Resistance Determining Region (QRDR) ของยีน gyrA และ gyrB ในเชื้อที่ดื้อต่อ ciprofloxacin และ/หรือ nalidixic acid จำนวน 60 ตัว ผลการวิจัยพบการปรากฏของยีน tetO ในเชื้อที่ดื้อต่อ tetracycline (97%, 65/67) และพบเชื้อที่มีการปรากฏยีน intl1 จำนวน 4 เชื้อ (4.8%, 4/83) ซึ่งเชื้อทั้งหมดให้ amplicons ขนาด 1000 bp เมื่อเพิ่มจำนวน DNA ด้วย 5’-3’ conserved sequence PCR และผลการตรวจหาลำดับเบส พบว่าเชื้อทุกตัวมียีน aadA9 ซึ่งควบคุมการดื้อต่อยาในกลุ่ม aminoglycosides โดยเชื้อที่ดื้อต่อ erythromycin จำนวน 77% (34/44) มีการกลายพันธุ์ของ 23S rRNA โดยพบการกลายพันธุ์แบบ point mutations 5 รูปแบบ และรูปแบบที่พบมากที่สุดคือ A2230G (70%, 31/44) เชื้อทุกตัวที่ดื้อต่อ nalidixic acid และ/หรือ ciproflocxacin มีการกลายพันธุ์ในส่วน QRDR ของยีน gyrA และ 8.5% (5/60) พบการกลายพันธุ์ในยีน gyrB การกลายพันธุ์ที่พบมากที่สุดใน gyrA คือ C257T (93%, 56/60) ซึ่งเปลี่ยนกรดอะมิโน threonine ที่ตำแหน่ง 86 เป็น isoleucine ส่วนการกลายพันธุ์ที่พบมากที่สุดใน gyrB คือ A1144C (7%, 4/60) ซึ่งเปลี่ยนกรดอะมิโน lysine ที่ตำแหน่ง 381 เป็น glutamic acid en
dc.format.extent 1048025 bytes
dc.format.mimetype application/pdf
dc.language.iso en es
dc.publisher Chulalongkorn University en
dc.relation.uri http://doi.org/10.14457/CU.the.2007.2039
dc.rights Chulalongkorn University en
dc.subject Campylobacter en
dc.subject Drug resistance en
dc.title Genetics of antibiotic resistance in campylobacter coli isolated from swine in Thailand en
dc.title.alternative พันธุกรรมการดื้อยาของ Campylobacter coli ที่แยกได้จากสุกรในประเทศไทย en
dc.type Thesis es
dc.degree.name Master of Science es
dc.degree.level Master's Degree es
dc.degree.discipline Veterinary Public Health es
dc.degree.grantor Chulalongkorn University en
dc.email.advisor Rungtip.C@Chula.ac.th, rchuanchuen@yahoo.com
dc.email.advisor Alongkorn.A@Chula.ac.th
dc.identifier.DOI 10.14457/CU.the.2007.2039


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record