การตรวจติดตามและศึกษาลักษณะทางพันธุศาสตร์ของเชื้อไวรัสไข้หวัดนก (H5N1)ในตลาดค้าสัตว์ปีกมีชีวิตและตลาดสดในกรุงเทพมหานครและจังหวัดใกล้เคียง

ชื่นสกนธ์ เชาว์ตระกูล

dc.contributor.advisor	อลงกร อมรศิลป์
dc.contributor.advisor	รุ่งทิพย์ ชวนชื่น
dc.contributor.author	ชื่นสกนธ์ เชาว์ตระกูล
dc.contributor.other	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะสัตวแพทยศาสตร์
dc.date.accessioned	2011-11-28T06:53:25Z
dc.date.available	2011-11-28T06:53:25Z
dc.date.issued	2550
dc.identifier.uri	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/16225
dc.description	วิทยานิพนธ์ (วท.ม.)--จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย, 2550	en
dc.description.abstract	การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อตรวจติดตามและศึกษาลักษณะพันธุศาสตร์ของเชื้อไข้หวัดนกสายพันธุ์ H5N1 จากสัตว์ปีกในตลาดค้าสัตว์ปีกมีชีวิตและตลาดสดในกรุงเทพมหานครและจังหวัดใกล้เคียง ระหว่างเดือนสิงหาคม พ.ศ. 2549-กรกฎาคม พ.ศ. 2550 โดยเก็บตัวอย่างจำนวน 836 ตัวอย่าง แบ่งเป็นตัวอย่างจากสัตว์ปีกมีชีวิตจำนวน 354 ตัวอย่าง และเนื้อสัตว์ปีกจำนวน 482 ตัวอย่าง จากนั้นนำตัวอย่างทั้งหมดมาเพาะแยกเชื้อไข้หวัดนกสายพันธุ์ H5N1 ด้วยวิธีการฉีดเข้าไข่ไก่ฟัก และตรวจพิสูจน์ด้วยวิธี hemagglutination test (HA) และ multiplex RT-PCR จากนั้นศึกษาลักษณะทางพันธุศาสตร์ด้วยวิธีการถอดรหัสพันธุกรรมของยีน hemagglutinin (H5) และ neuraminidase (N1) วิเคราะห์รหัสพันธุกรรมด้วยวิธี phylogenetic analysis และวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของกรดอะมิโนในตำแหน่งต่างๆ ที่มีความสำคัญบนยีน H5 และ N1 ผลการศึกษาพบอุบัติการณ์ของเชื้อไข้หวัดนกสายพันธุ์ H5N1 คิดเป็น 1.4 เปอร์เซ็นต์ (12/836) โดยเชื้อไข้หวัดนกที่พบเป็นเชื้อไข้หวัดนกชนิดก่อโรครุนแรง (Highly Pathogenic Avian Influenza; HPAI) ซึ่งพบการเรียงตัวของกรดอะมิโนชนิดเบสหลายตัวที่ HA cleavage site และการลดจำนวนของกรดอะมิโน 20 ตัว ที่ NA stalk region รวมถึงไม่พบการเปลี่ยนแปลงของกรดอะมิโนในตำแหน่งที่มีความสำคัญต่อการกลายพันธุ์ การศึกษาทาง phylogenetic analysis ของยีน H5 และ N1 พบว่า เชื้อไข้หวัดนกที่พบจัดอยู่ในกลุ่มเดียวกันกับเชื้อที่แยกได้ในประเทศไทยและประเทศเวียดนาม (genotype Z) ดังนั้นเชื้อไข้หวัดนกที่พบในตลาดค้าสัตว์ปีกมีชีวิตและตลาดสดมีความใกล้เคียงกับเชื้อไข้หวัดนกที่แยกได้ในประเทศไทยในปี พ.ศ. 2547-2548 การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นว่ามีการปนเปื้อนของเชื้อไข้หวัดนกในตลาดค้าสัตว์ปีกมีชีวิตและตลาดสด ดังนั้นการเฝ้าระวังโรคและลดความเสี่ยงของเชื้อไข้หวัดนกในตลาดค้าสัตว์ปีกมีชีวิตและตลาดสดจะช่วยควบคุมและป้องกันการติดเชื้อไข้หวัดนกสายพันธุ์ H5N1 ในคน	en
dc.description.abstractalternative	The aims of this study were to monitor and characterize avian influenza virus (H5N1) in live bird and food markets in Bangkok and vicinity, Thailand, from August 2006 to July 2007. Eight hundreds and thirty six samples, including 354 live birds and 482 bird meats, were collected from the markets. H5N1 viruses were isolated, identified and characterized using embryonated egg inoculation, hemagglutination assay (HA), multiplex RT-PCR, nucleotide sequencing and phylogenetic analysis. The results revealed that the incidence of avian influenza virus (H5N1) was 1.4% (12/836). The viruses had common genetic characteristics of Highly Pathogenic Avain Influenza (HPAI), with multiple basic amino acids in the HA cleavage site and a 20-amino acid deletion on NA stalk region. No significant point mutations were identified in critical regions of HA and NA genes. Phylogenetic analysis of the HA and NA genes showed that the viruses clustered within the lineage of H5N1 avian isolates from Thailand and Vietnam (genotype Z). Therefore, H5N1 viruses circulating in live birds and bird meats were more genetically related to H5N1 viruses in 2004-2005 in Thailand. In summary, this study presented the evidence of HPAI contamination in live bird and food markets. Increased public awareness of the risks of H5N1 virus associated with live bird and food markets will help prevent and control H5N1 infection in humans.	en
dc.format.extent	5608906 bytes
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.language.iso	th	es
dc.publisher	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en
dc.relation.uri	http://doi.org/10.14457/CU.the.2007.408
dc.rights	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en
dc.subject	ไข้หวัดนก	en
dc.subject	สัตว์ปีก -- โรคเกิดจากไวรัส	en
dc.title	การตรวจติดตามและศึกษาลักษณะทางพันธุศาสตร์ของเชื้อไวรัสไข้หวัดนก (H5N1)ในตลาดค้าสัตว์ปีกมีชีวิตและตลาดสดในกรุงเทพมหานครและจังหวัดใกล้เคียง	en
dc.title.alternative	Monitoring and genetic characterization of Avian influenza virus (H5N1) from avian species in live bird and food markets in Bangkok and vicinity	en
dc.type	Thesis	es
dc.degree.name	วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต	es
dc.degree.level	ปริญญาโท	es
dc.degree.discipline	สัตวแพทยสาธารณสุข	es
dc.degree.grantor	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en
dc.email.advisor	Alongkorn.A@Chula.ac.th
dc.email.advisor	rchuanchuen@yahoo.com
dc.identifier.DOI	10.14457/CU.the.2007.408