การศึกษาลักษณะทางพันธุกรรมของยีน NSP-2 ของเชื้อไวรัสพีอาร์อาร์เอสที่แยกได้จากสุกรที่ติดเชื้อร่วมของสายพันธุ์อเมริกาเหนือและยุโรป

เดชฤทธิ์ นิลอุบล; ธิติมา ไตรพิพัฒน์; ธวัชชัย หุ่นสุวรรณ; กัญจน์ เตมียะเสน

dc.contributor.author	เดชฤทธิ์ นิลอุบล
dc.contributor.author	ธิติมา ไตรพิพัฒน์
dc.contributor.author	ธวัชชัย หุ่นสุวรรณ
dc.contributor.author	กัญจน์ เตมียะเสน
dc.contributor.other	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะสัตวแพทยศาสตร์
dc.date.accessioned	2018-05-28T09:07:33Z
dc.date.available	2018-05-28T09:07:33Z
dc.date.issued	2554
dc.identifier.uri	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/58956
dc.description.abstract	เชื้อไวรัสพีอาร์อาร์เอสแบ่งออกเป็น 2 สายพันธุ์หลักคือสายพันธุ์อเมริกาเหนือและสายพันธุ์ยุโรป สำหรับประเทศไทยพบการติดเชื้อไวรัสพีอาร์อาร์เอสทั้งสองสายพันธุ์ งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมในส่วน Non-structural protein (Nsp) – 2 ของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกรที่ติดเชื้อร่วมทั้งสองสายพันธุ์ และได้ดำเนินงานวิจัยโดย นำซีรั่มจากสุกรจากการทดลองที่ผ่านมา แบ่งออกเป็นกลุ่มที่ได้รับการฉีดเชื้อไวรัสพีอาร์อาร์เอสสายพันธุ์อเมริกาเหนือ (US) VR-2332 หรือสายพันธุ์ยุโรป (EU) Lylestad virus และกลุ่มที่ได้รับเชื้อไวรัสพีอาร์อาร์เอสร่วมทั้งสองสายพันธุ์คือสายพันธุ์อเมริกาเหนือและสายพันธุ์ยุโรป (MIX) (VR-2332 และ Lylestad virus) ที่ช่วงเวลา 5 10 และ 30 วันหลังการให้เชื้อ มาทำการแยกเชื้อไวรัสและถอดรหัสทางพันธุกรรมส่วนยีน Nsp-2 ทั้งบางส่วน (partial) และทั้งหมด (complete) เพื่อเปรียบเทียบที่ช่วงเวลาต่างกัน ผลการถอดรหัสพันธุกรรมของลำดับเบสของยีน Nsp-2 พบว่าเชื้อไวรัสลูกหลานของสายพันธุ์อเมริกาเหนือ ที่แยกได้จากกลุ่ม MIX มีความแตกต่างทางพันธุกรรมมากกว่าเชื้อไวรัสลูกหลานของสายพันธุ์อเมริกาเหนือ ที่แยกได้จากกลุ่ม US และเมื่อเปรียบเทียบกับเชื้อไวรัสต้นแบบสายพันธุ์ อเมริกาเหนือ VR-2332 พบว่าสามารถแบ่งเชื้อไวรัสลูกหลานของสายพันธุ์อเมริกาเหนือ ที่แยกได้จากกลุ่ม MIX ออกได้เป็น 2 คลัสเตอร์ โดยคลัสเตอร์ที่ 1 มีลักษณะพันธุกรรมที่ใกล้เคียงกับเชื้อไวรัสต้นแบบสายพันธุ์อเมริกาเหนือ VR-2332 และคลัสเตอร์ที่ 2 มีลักษณะพันธุกรรมที่ต่างจากไวรัสต้นแบบสายพันธุ์อเมริกาเหนือ VR-2332 ในขณะที่เชื้อไวรัสลูกหลานของกลุ่ม US อยู่ในคลัสเตอร์ที่ 1 เท่านั้น ส่วนเชื้อไวรัสลูกหลานสายพันธุ์ยุโรปมีลักษณะพันธุกรรมที่เหมือนกับเชื้อไวรัสตันแบบ Lylestad virus โดยสรุปเชื้อไวรัสลูกหลานของทั้งสองสายพันธุ์มีวิวัฒนาการแยกกันและไม่เกี่ยวข้องกัน แต่ในกลุ่มที่มีการติดเชื้อร่วมมีการเกิดการกลายพันธุ์มากกว่ากลุ่มที่ติดเชื้อเดี่ยว	en_US
dc.description.abstractalternative	Two distinct genotypes, European (EU) and North American (NA), of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses (PRRSV) are recognized and have emerged separately in each continent. Both genotypes had been isolated in Thailand. The objectives of the study were to investigate genetic evolution of non-structural protein (Nsp)–2 of PRRSV isolated from pigs dually infected with EU and NA isolates. Virus was isolated from serum of 5 pigs of each of 3 treatment groups at 5, 10 and 30 days post infection. Three treatment groups, previously conducted, consisted of EU and US in which pigs in these 2 groups were intranasally challenged with EU and US, respectively. The third group was MIX in which pigs were intranasally challenged with both EU and US isolates. RNA was extracted from viruses and converted to cDNA. PCR was performed on cDNA using specific to Nsp-2 gene. It was demonstrated that progeny viruses belonging to US genotypes were groups into 2 clusters. Progeny US viruses detected in the US group were grouped in the cluster I only, where as that of the MIX groups were grouped in both clusters suggesting more mutation rate in co-infected than single infected group. Progeny EU viruses, however, were identical to EU isolate used in the challenge. In addition, no recombination was observed. In conclusion, the results suggested that progeny viruses of each genotype independently evolved, but mutation rate was higher in the co-infected than the single infected group.	en_US
dc.description.sponsorship	ได้รับทุนอุดหนุนการวิจัยจากงบประมาณแผ่นดิน ประจำปีงบประมาณ 2553	en_US
dc.language.iso	th	en_US
dc.publisher	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.rights	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.subject	สุกร -- โรคเกิดจากไวรัส	en_US
dc.subject	สุกร -- โรคเกิดจากไวรัส -- แง่พันธุศาสตร์	en_US
dc.subject	โรคพีอาร์อาร์เอส	en_US
dc.subject	โรคพีอาร์อาร์เอส -- แง่พันธุศาสตร์	en_US
dc.subject	Swine -- Virus diseases	en_US
dc.subject	Swine -- Virus diseases -- Genetic aspects	en_US
dc.subject	Porcine reproductive and respiratory syndrome	en_US
dc.subject	Porcine reproductive and respiratory syndrome -- Genetic aspects	en_US
dc.title	การศึกษาลักษณะทางพันธุกรรมของยีน NSP-2 ของเชื้อไวรัสพีอาร์อาร์เอสที่แยกได้จากสุกรที่ติดเชื้อร่วมของสายพันธุ์อเมริกาเหนือและยุโรป	en_US
dc.title.alternative	Genetic characterization NSP-2 gene of PRRS viruses isolated from pigs dually infected with US and EU isolates	en_US
dc.type	Technical Report	en_US
dc.email.author	Dachrit.N@Chula.ac.th
dc.email.author	thitima.t@chula.ac.th
dc.email.author	ไม่มีข้อมูล
dc.email.author	ไม่มีข้อมูล