MRI brain segmentation : โครงการวิจัยโครงการย่อยที่ 4 : รายงานฉบับสมบูรณ์

นงลักษณ์ โควาวิสารัช

Please use this identifier to cite or link to this item: https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/13254

Title:	MRI brain segmentation : โครงการวิจัยโครงการย่อยที่ 4 : รายงานฉบับสมบูรณ์
Other Titles:	MRI brain segmentation
Authors:	นงลักษณ์ โควาวิสารัช
Email:	Nongluk.C@Chula.ac.th
Other author:	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะวิศวกรรมศาสตร์
Subjects:	สมอง -- การสร้างภาพจากการกำทอนในสนามแม่เหล็ก การประมวลผลภาพ -- เทคนิคดิจิตอล
Issue Date:	2546
Publisher:	คณะวิศวกรรมศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
Abstract:	ศึกษา ออกแบบเทคนิควิธีการแบ่งส่วนภาพของสมองและพัฒนาโปรแกรมเพื่อแบ่งส่วนภาพของสมองจากชุดภาพถ่าย MRI ของสมองโดยใช้วิธีใช้ค่าขีดแบ่งและวิธี 3D morphological watershed เป็นวิธีแบ่งส่วนแบบอัตโนมัติ โดยวิธีการแบ่งส่วนโดยอัตโนมัติที่ใช้ค่าขีดแบ่งที่พัฒนาขึ้น พัฒนาจากพื้นฐานความรู้ที่ว่าระดับความสว่างของสมองแบบ White matter, gray matter และ CSF ในภาพ T1-weighted MRI ของสมองจะมีความสว่างจากมากไปน้อย ดังนั้นวิธีใช้ค่าขีดแบ่งที่พัฒนานี้จึงให้ผลการแบ่งส่วนสมองที่ดีกับภาพที่มีข้อมูลในลักษณะดังกล่าว ส่วนวิธี 3D morphological watershed เป็นวิธีที่เหมาะจะใช้ภาพที่บริเวณสมองมีความสว่างที่กลมกลืนกันและไม่แตกต่างกันมาก ไม่ควรมีสัญญาณรบกวนและควรเป็นบริเวณที่แยกจากส่วนอื่นๆ อย่างค่อนข้างชัดเจน แต่ข้อมูลภาพ MRI ส่วนมากมีความหลากหลายเนื่องจากปัจจัยต่างๆ เช่น การเลือกวิธีการจัดทำข้อมูลภาพมีหลากหลาย เช่น ทำเป็น T1-weighted หรือ T2-weighted ด้วยเทคนิคย่อยต่างๆ การเลือกความหนาของสไลซ์ รวมถึงลักษณะของเครื่อง MRI เอง ทำให้ผลการแบ่งส่วนสมองจากภาพ MRI แบบอัตโนมัติมีความหลากหลายทั้งดีและไม่ดี ดังนั้น ในงานวิจัยนี้จึงได้จัดทำโปรแกรมเครื่องมือซอฟต์แวร์ให้ผู้ใช้สามารถเลือกแบ่งส่วนภาพด้วยตนเองรวมทั้งมีตัวกระทำการ Preprocessing เช่น การทำ Normalization การทำ Diffusion และ Post processing เช่นตัวกระทำการทางสัณฐานวิทยาต่างๆ เพื่อให้ผู้ใช้สามารถปรับปรุงข้อมูลก่อนและหลังจากการแบ่งส่วนโดยอัตโนมัติได้ด้วย
Other Abstract:	To study and design techniques and develop a program for segmenting brain from brain MR image set. Automatic thresholding and 3D morphological watershed are the two methods for automatic segmentation. The automatic thresholding method is implemented based on the knowledge about the intensities of white matter, gray matter and CSF of the brain in T1-weighted MRI. Hence, the automatic thresholding method gives good segmentation results for such images. The 3D morphotogical watershed is implemented to suit the image that brain regions are smooth, do not have distinct noise and the brain regions should be separated from non-brain regions quite clearly. There are many factors that make MR images very much vary, such as the T1-weighted or T2-weighted type taken with many different techniques, the slice thickness, and the characteristics of the MR machine itself. Consequently, segmentation results from automatic segmentation methods also vary among different datasets. Therefore, the implemented program in this research provide manual segmentation tools, preprocessing tools (such as normalization and diffusion), and post processing tools (morphological operators) so that users can improve the image data prior to or after automatic segmentation.
URI:	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/13254
Type:	Technical Report
Appears in Collections:	Eng - Research Reports

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
Nongluk_MRI.pdf		9.59 MB	Adobe PDF	View/Open

Show full item record