Please use this identifier to cite or link to this item:
https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/14526
Title: | Genetics of antimicrobial resistance in Vibrio species isolated from farmed marine shrimps in Thailand |
Other Titles: | พันธุกรรมการดื้อยาต้านจุลชีพของเชื้อวิบริโอที่แยกได้จากกุ้งทะเลเพาะเลี้ยงในประเทศไทย |
Authors: | Sirikorn Kitiyodom |
Advisors: | Rungtip Chuanchuen Janenuj Wongtavatchai |
Other author: | Chulalongkorn University. Faculty of Veterinary Science |
Advisor's Email: | Rungtip.C@Chula.ac.th, rchuanchuen@yahoo.com No information provided |
Subjects: | Drug resistance Vibrio Vibrio cholerae Vibrio vulnificus Shrimps -- Thailand |
Issue Date: | 2008 |
Publisher: | Chulalongkorn University |
Abstract: | A total of 83 Vibrio isolates from farmed marine shrimps, comprising V. parahaemolyticus (n=26), V. cholera (n=8), V.fluvalis (n=23) and V. vulnificus (n=16) were included in this study. Susceptibilities to 10 antimicrobials were determined. The occurrence and characteristics of class1, 2 and 3 integrons were investigated. The presence of tet(K), tet(L), tet(M), tet(O) and tet(S) genes were examined. Seventeen isolates resistant to ciprofloxacin and/or enrofloxacin were examined for mutations the Quinolone Resistance Determinig Regions (QRDRs) of gyrA and parC genes. Seventy-four isolates (89%) were resistant to at least one antibiotic and 17 isolates (21%) were multidrug-resistant. Most of the Vibrio isolates (62%) were resistant to ampicillin and the most common resistance pattern was the AMP-SMX-TMP (4.82%). As class 1 integrons were identified in 6%, no class 2 and 3 intrgrons were detected. Only one class 1 integrons in a V. cholera isolate carried gene cassettes. Nucleotide sequrncing analysis revealed that the inserted gene cassette was the partial rumA gene. All of class 1 integrons did not harbor the typical 3’conserved segment. None of the isoloates possessed tet genes tested. As Ser-83-lle substitution in GyrA was the major mutation identified in the fluoroquinolone-resistant isolates (59%), no mutation in ParC was observed. The results warranted further studies to investigate other mechanisms underlying resistance to antibiotics in the Vibrio isolates from farmed marine shrimps. |
Other Abstract: | ศึกษาพันธุกรรมการดื้อยาต้านจุลชีพของเชื้อวิบริโอจำนวน 83 เชื้อที่แยกได้จากกุ้งทะเลเพาะเลี้ยงในประเทศไทย ประกอบด้วยเชื้อ V.parahaemolyticus จำนวน 26 เชื้อ V. cholera จำนวน 18 เชื้อ V.fluvalis จำนวน 23 เชื้อ และ V.vulnificus จำนวน 16 เชื้อ ทำการศึกษาความไวรับของเชื้อต่อยาปฏิชีวนะจำนวน 10 ชนิด ตรวจหาปรากฏและศึกษาลักษณะของ class1,2 และ 3 intergrons ในเชื้อทุกตัว ตรวจหาปรากฏของยีน tet(K), tet(L0, tet(O) และ tet(S) ในเชื้อทุกตัว และตรวจการกลายพันธุ์ในส่วน Quinolone Resistance Determining Regions (QRDRs) ของยีน gyrA และ parC ในเชื้อที่ดื้อต่อ ciprofloxacin และ/หรือ enrofloxacin จำนวน 17 ตัว ผลการวิจัยพบว่ามีเชื้อวิบริโอที่ดื้อต่อยาปฏิชีวนะอย่างน้อยหนึ่งชนิด 74 เชื้อ (89%) และมีเชื้อที่ดื้อต่อยาปฏิชีวนะหลายชนิดพร้อมกัน 17 เชื้อ (21%) โดยเชื้อวิบริโอดื้อต่อยา ampicillin มากที่สุด(62%) และมีรูปแบบการดื้อยาที่พบมากที่สุดคือ AMP-SMX-TMP (4.82%) พบเชื้อทีมีการปรากฎของ class 1 integrons คิดเป็น 6% และไม่พบปรากฏของ class 2 และ 3 integrons ในเชื้อตัวใด โดยมีเชื้อ V.cholera จำนวน 1 เชื้อที่มีการปรากฏของ gene cassettes จากผลการถอดรหัสพันธุกรรมพบว่า gene cassettes ที่แทรกตัวอยู่คือบางส่วนของยีน rumA และเชื้อทุกตัวที่มีการปรากฏของ class 1 integrons ไม่พบมีการปรากฏของส่วน typical 3’conserved segment เชื้อทุกตัวไม่พบมีการปรากฏของยีน tet ที่ทำการศึกษาเชื้อที่ดื้อต่อ ciprofloxacin และ/หรือ enrogloxacin มีการกลายพันธุ์ในส่วน QRDR ของยีน gyrA คือ G248T (59%)ซึ่งเปลี่ยนกรดอะมิโน serine เป็น isoleucine ที่ตำแหน่ง 83 และไม่พบว่าเชื้อตัวใดมีการกลายพันธุ์ในส่วนของยีน parC จากผลการวิจัยครั้งนี้แสดงให้เห็นว่า ควรมีการศึกษาพันธุกรรมการดื้อยาของเชื้อวิบริโอที่แยกได้จากการเพาะเลี้ยงกุ้งทะเลเพิ่มเติมต่อไป |
Description: | Thesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2008 |
Degree Name: | Master of Science |
Degree Level: | Master's Degree |
Degree Discipline: | Veterinary Public Health |
URI: | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/14526 |
URI: | http://doi.org/10.14457/CU.the.2008.1617 |
metadata.dc.identifier.DOI: | 10.14457/CU.the.2008.1617 |
Type: | Thesis |
Appears in Collections: | Vet - Theses |
Files in This Item:
File | Description | Size | Format | |
---|---|---|---|---|
sirikorn_ki.pdf | 5.2 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.