Please use this identifier to cite or link to this item: http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/26053
Title: Characteristics of multidrug-resistant Escherichia coli isolated from fattening pigs
Other Titles: ลักษณะของเชื้อเอสเชอริเซีย โคไล ที่ดื้อยาหลายชนิดพร้อมกันที่แยกได้จากสุกร
Authors: Khin Khin Lay
Advisors: Rungtip Chuanchuen
Other author: Chulalongkorn University. Faculty of Veterinary Science
Advisor's Email: Rungtip.C@Chula.ac.th, rchuanchuen@yahoo.com
Subjects: Escherichia coli
Swine
Genes
Drug resistance
Issue Date: 2011
Publisher: Chulalongkorn University
Abstract: Three hundred and forty-four Escherichia coli isolates from clinically healthy fattening pigs were evaluated for susceptibilities to 8 antimicrobials, class1 integrons, antimicrobial resistance genes, mutation in Quinolone Resistance-Determining Regions (QRDRs), virulence genes and phylogenetic groups. E. coli isolates were resistant to tetracycline (96.2%) and followed by ampicillin (91.6%). Seventy-three percent contained intI1 gene, of which 22.3% carried inserted gene cassettes, i.e., incomple sat, aadA22, aadA1, dfrA12-aadA2, and sat-psp-aadA2. Two most commonly observed gene cassettes were aadA2 (42.9%) and aadA1 (26.8%). Horizontal transfer of class 1 integrons was detected in 8 E. coli isolates with class1 integrons carrying dfrA12-aadA2 gene cassettes. Sixteen resistance genes were detected in E. coli isolates and their presence was correlated to resistant phenotype. The amino acid substitutions Ser-83-Leu, Asp-87-Asn and Gln-94-Pro were observed in GyrA and Ser-58-Ile in ParC. Ten virulence genes including elt, estA, estB, astA, faeG, fasA, fedA, eseA, paa and sepA were detected, of which fasA (98.3%) was most commonly observed. Eighty-two percent of the E. coli isolates were assigned to group B1 followed by group A (8%), B2 (7%) and D (3%). Statistically-significant associations were found among the specific virulence genes, the specific resistance phenotypes and genotypes (P<0.05). The results supported the significant role of commensal E. coli as reservoirs for antimicrobial resistance determinants and virulence factors.
Other Abstract: ทำการศึกษาใน Escherichia coli จำนวน 344 เชื้อ ที่แยกได้จากสุกรสุขภาพดี โดยศึกษาความไวต่อยาปฏิชีวนะจำนวน 8 ชนิด ลักษณะทางพันธุกรรมของ class 1 integrons ยีนดื้อยา การกลายพันธุ์ในส่วน Quinolone Resistance-Determining Regions (QRDRs) ยีนที่ก่อให้เกิดความรุนแรงของโรค และ phylogenetic group พบว่าในการศึกษาความไวต่อยาปฏิชีวนะเชื้อดื้อต่อยาเตตร้าซัยคลิน (92.6%) และแอมพิซิลิน (91.6%) การศึกษา class 1 integrons พบการปรากฏของยีน intI1 ร้อยละ 73 ซึ่งมี gene cassette ร้อยละ 22.3 โดย gene cassette array ที่พบคือยีน aadA22 aadA1 dfrA12-aadA2 และ sat-psp-aadA2 ซึ่ง gene cassette ที่พบมากที่สุดคือยีน aadA2 (42.9%) และ aadA1 (26.8%) พบการถ่ายทอดของ class 1 integrons ใน 8 isolates โดย class 1 integrons ที่ถ่ายทอดได้ทั้งหมดมี gene cassette array แบบ dfrA12-aadA2 พบยีนดื้อยาทั้งหมด 16 ชนิดซึ่งการปรากฏของยีนเป็นไปในทิศทางเดียวกับรูปแบบการดื้อยา การศึกษาการกลายพันธุ์ในส่วน Quinolone Resistance-Determining Regions (QRDRs) พบการเปลี่ยนแปลงกรดอะมิโนของยีน gyrA ได้แก่ Ser-83-Leu Asp-87-Asn และ Gln-94-Pro ในส่วนของยีน parC พบการเปลี่ยนแปลงของ Ser-58-Ile ตรวจพบยีนที่ก่อให้เกิดความรุนแรง 10 ยีน ได้แก่ elt estA estB astA faeGn fasA fedA eseA paa และ sepA โดยยีนที่พบมากที่สุดคือ fasA (98.3%) เมื่อจัด phylogenetic group พบว่าร้อยละ 82 ของเชื้อที่ทำการศึกษาจัดอยู่ใน group B1 รองลงมาคือ group A (8%) group B2 (7%) และ group D (3%) การปรากฏของยีนที่ก่อให้เกิดความรุนแรง ยีนดื้อยาและการแสดงออกของการดื้อยามีความเกี่ยวข้องกันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ (p<0.05) ผลการศึกษาพบว่าเชื้อเอสเชอริเชีย โคไลที่พบในสุกรสุขภาพดีมีความสำคัญในการกระจายของยีนดื้อยาและยีนควบคุมที่ก่อให้เกิดความรุนแรงของโรค
Description: Thesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2011
Degree Name: Doctor of Philosophy
Degree Level: Doctoral Degree
Degree Discipline: Veterinary Public Health
URI: http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/26053
Type: Thesis
Appears in Collections:Vet - Theses

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
khinkhin_la.pdf2.3 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.