Please use this identifier to cite or link to this item:
https://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/78721
| Title: | การศึกษาวิวัฒนาการเชิงโมเลกุลของยีนที่สังเคราะห์เส้นใยโครงสร้างหลักในใยแมงมุม (MaSp1) |
| Other Titles: | Molecular phylogenetic study of spider dragline silk gene (MaSp1) |
| Authors: | กชกร วรนิตย์ |
| Advisors: | ณัฐพจน์ วาฤทธิ์ |
| Other author: | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะวิทยาศาสตร์ |
| Subjects: | ใยแมงมุม ยีน Spider webs Genes |
| Issue Date: | 2562 |
| Publisher: | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย |
| Abstract: | ใยแมงมุม (spider silk) เป็นเส้นใยโปรตีนที่แมงมุมสร้างขึ้นมาเพื่อใช้ในการดำรงชีวิต ซึ่งใยแมงมุมถือเป็นวัสดุชีวภาพที่มีความโดดเด่นหลายประการ และมีความสำคัญทางอุตสาหกรรมในหลากหลายด้าน โดยทั่วไปสามารถจำแนกประเภทของใยตามหน้าที่การใช้งานและชนิดของต่อมที่ใช้สร้างใยได้ 7 ชนิด ทั้งนี้ชนิดของเส้นใยที่มีความสำคัญและมีข้อมูลทางการศึกษามากที่สุดคือ เส้นใยโครงสร้างหลัก (dragline silk) ซึ่งถูกควบคุมด้วยยีน Major ampullate Spidroin 1 (MaSp1) และยีน Major ampullate Spidroin 2 (MaSp2) แต่อย่างไรก็ตามในปัจจุบันพบว่าข้อมูลทางพันธุกรรมเกี่ยวกับวิวัฒนาการของยีนที่ผลิตเส้นใยโครงสร้างหลักในใยแมงมุม อย่างยีน MaSp1 ยังมีอยู่ไม่มากนัก ในการศึกษาครั้งนี้ผู้ศึกษาได้เลือกตัวอย่างที่นำมาใช้ทั้งหมด 13 สปีชีส์ โดยมี 3 สปีชีส์มาจากการทำ 10x Genomic Sequencing และตัวอย่างแมงมุมอีก 10 สปีชีส์มาจาก Spider Assembly Genome โดยดาวน์โหลดจากฐานข้อมูล GenBank จากนั้นนำลำดับนิวคลีโอไทด์ของแมงมุมทั้ง 13 สปีชีส์มาระบุตำแหน่งของยีน MaSp1 ที่มีการรายงานไว้ในฐานข้อมูลดังกล่าว และนำไปสร้างแผนภูมิวงศ์วานทางวิวัฒนาการ (Phylogenetic tree) เพื่อหาความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของยีน MaSp1 ระหว่างชนิดของแมงมุมทั้ง 13 สปีชีส์ ด้วยการวิเคราะห์แบบ Bayesian Inference (BI) ผลจากการสร้างแผนภูมิวงศ์วานวิวัฒนาการพบว่า แมงมุมวงศ์ Nephilidae และแมงมุมวงศ์ Araneidae ถูกจัดอยู่ใน clade เดียวกัน ซึ่งสอดคล้องกับงานวิจัยก่อนหน้านี้ เนื่องจากเป็นแมงมุมในกลุ่มที่สร้างใยกลม (Orb-weaver spider) และนอกจากนั้นแมงมุมกลุ่มดังกล่าวยัง clade กับแมงมุมกลุ่ม Theridiidae เนื่องจากแมงมุม Latrodectus sp., Nephila sp. และ Argiope sp. มีบรรพบุรุษร่วมกันเมื่อ 135–160 ล้านปีก่อน อย่างไรก็ตามลำดับนิวคลีโอไทด์จากยีน MaSp1 ไม่สามารถแสดงความสัมพันธ์ภายในแมงมุมกลุ่มอื่นได้ |
| Other Abstract: | Spider silk is a protein fiber spun by spider use for life existence. Spider silk is also biological materials that have outstanding benefits and importance for industry. All spider silk can produce 7 different types for different uses and glands. Dragline silk is the most important silk and most of study specific to this type. This silk controlled by Major ampullate Spidroin 1 gene (MaSp1) and Major ampullate Spidroin 2 gene (MaSp2). Nevertheless, there are few studies about evolution of dragline silk gene. In this study, we select 13 species for taxa selection. There are 3 species from 10x Genomic Sequencing and 10 species from Spider Assembly Genome downloaded from GenBank. Then, annotated MaSp1 gene position in nucleotide sequence from 13 species. After that, utilized for Phylogenetic analysis using Bayesian Inference (BI). The phylogenetic analysis reveals that spider from family Nephilidae are grouped in the same clade with family Araneidae that correspond with previous study because they are Orb-weaver spider. In addition, spiders from 2 families are claded together with spiders from family Theridiidae due to Latrodectus sp., Nephila sp. and Argiope sp., have common ancestor since 135–160 MYA, Nevertheless, MaSp1 gene cannot resolve the relationship among another group of spiders. |
| Description: | โครงงานเป็นส่วนหนึ่งของการศึกษาตามหลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาชีววิทยา. คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ปีการศึกษา 2562 |
| URI: | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/78721 |
| Type: | Senior Project |
| Appears in Collections: | Sci - Senior Projects |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| 62-SP-BIO-003 _ Kochakorn Woranit.pdf | 1.48 MB | Adobe PDF | View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.