ลักษณะทางอณูชีววิทยาของยีนสไปค์และยีนนิวคลีโอแคปซิดของเชื้อไวรัสโรคท้องร่วงติดต่อในสุกร (ไวรัสพีอีดี) ที่แยกได้จากฟาร์มสุกร

สุพรรษา ต่วนทัพ

dc.contributor.advisor	สุพจน์ วัฒนะพันธ์ศักดิ์
dc.contributor.advisor	พรชลิต อัศวชีพ
dc.contributor.advisor	จุฑาทิพย์ เขียวเจริญ
dc.contributor.author	สุพรรษา ต่วนทัพ
dc.contributor.other	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะสัตวแพทยศาสตร์
dc.date.accessioned	2020-07-21T08:20:47Z
dc.date.available	2020-07-21T08:20:47Z
dc.date.issued	2555
dc.identifier.uri	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/67175
dc.description	วิทยานิพนธ์ (วท.ม.)--จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย, 2555	en_US
dc.description.abstract	เชื้อไวรัสโรคท้องร่วงติดต่อในสุกรหรือเชื้อไวรัสพีอีดีก่อให้เกิดอาการท้องเสียเฉียบพลัน, อาเจียนและขาดน้ำอย่างรุนแรง ซึ่งส่งผลให้ลูกสุกรที่มีอายุน้อยกว่า 7 วันตายอย่างรวดเร็ว โดยประเทศไทยพบการระบาดของไวรัสพีอีดีตั้งแต่ปี พ.ศ. 2550 และในปัจจุบันยังคงพบการระบาดของโรคในบางพื้นที่ โดยในการศึกษาครั้งนี้ได้ทำการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมและทำการจัดกลุ่มสายพันธุ์ของเชื้อไวรัสพีอีดีที่แยกได้จากสุกรป่วยจำนวน 21 ตัวอย่าง ระหว่างปี พ.ศ. 2554-2555 โดยการวิเคราะห์และเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์และกรดอะมิโนของยีสไปค์และยีนนิวคลีโอแคปซิดกับสายพันธุ์อ้างอิงของประเทศไทย, สายพันธุ์วัคซีน และสายพันธุ์อ้างอิงที่มีรายงานในฐานข้อมูล ผลการศึกษาพบว่าไวรัสพีอีดีที่แยกได้ระหว่างปี พ.ศ. 2554-2555 ในส่วนยีนสไปค์แสดงความใกล้เคียงทางพันธุกรรมต่อกันระหว่าง 90.50-100% ยกเว้น 1 สายพันธุ์ที่แสดงความแตกต่างทางพันธุกรรมกับสายพันธุ์อื่นที่ 90.50-93.55% ทำให้สายพันธุ์ที่มีความแตกต่างนี้ไม่ถูกจัดรวมอยู่ในกลุ่มเดียวกันกับสายพันธุ์ไทยส่วนใหญ่ส่วนการวิเคราะห์ในส่วนยีนนิวคลีโอแคปชิด พบว่าไวรัสพีอีดีที่แยกในระหว่างปี พ.ศ. 2554-2555 มีความใกล้เคียงทางพันธุกรรมต่อกันระหว่าง 97.67-100% และทุกสายพันธุ์ถูกจัดอยู่ในกลุ่มเดียวกัน นอกจากนี้การวิเคราะห์ในส่วนยีนสไปค์ของไวรัสพีอีดีที่แยกได้ระหว่างปี พ.ศ. 2554-2555 กับสายพันธุ์อ้างอิง พบว่ามีความใกล้เคียงทางพันธุกรรมกับไวรัสพีอีดีของประเทศไทยที่แยกได้ในอดีตและไวรัสพีอีดีสายพันธุ์จากประเทศจีนที่ 90.50-99.53% และ 96.26-98.82% ตามลำดับ ซึ่งสอดคล้องกันกับผลการวิเคราะห์ในส่วนยีนนิวคลีโอแคปซิด แสดงว่าไวรัสพีอีดีที่แยกได้ในการศึกษาครั้งนี้มีความใกล้เคียงทางพันธุกรรมสายพันธุ์จากประเทศจีน ที่ 94.00-99.52% ดังนั้นไวรัสพีอีดีที่แยกได้ระหว่างปี พ.ศ. 2554-2555 อาจมีต้นกำเนิดมาจากเชื้อไวรัสพีอีดีสายพันธุ์ประเทศจีน	en_US
dc.description.abstractalternative	Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) causes acute diarrhea, vomiting, severe dehydration and lead to sudden death in neonatal pigs less than 7 days old. The outbreak of PEDV in Thailand has been found since 2007 and remains spreading into many areas. In this study, the genetic diversity of twenty-one PEDV isolates from pig cases during 2011-2012 based on partial spike (S) and nucleocapsid (N) gene sequences was investigated by comparing with previous Thai isolates, PED vaccine strains and reference PEDV isolates. Based on partial S gene sequence, the current Thai isolates shared genetic similarity between 90.50-100% Among this comparison, only one isolate was separated from main cluster and shared the lowest nucleotide identity ranging from 90.50-93.55% to others. Regarding to partial N gene sequence, the genetic relationship among current isolates had more close relationship with a ranging from 97.67-100% of nucleotide identity and all current isolates were located in the same clade. Furthermore, the current isolates had S gene sequence closely related to previous Thai and Chinese isolates by sharing nucleotide identity between 97.55-99.53% and 96.26-98.82%, respectively. For partial N gene sequence analysis, current Thai isolates also shared high nucleotide similarity to Chinese isolates between 94.00-99.52%. Therefore, the Thai PEDV isolates during 2011-2012 might have been originated from Chinese clade.	en_US
dc.language.iso	th	en_US
dc.publisher	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.rights	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.subject	ท้องร่วงในสุกร	en_US
dc.subject	ไวรัส	en_US
dc.subject	ไวรัสพีอีดี	en_US
dc.subject	ลำดับนิวคลีโอไทด์	en_US
dc.subject	ชีววิทยา -- การจำแนก	en_US
dc.subject	Diarrhea in swine	en_US
dc.subject	Viruses	en_US
dc.subject	Porcine epidemic diarrhea virus	en_US
dc.subject	Nucleotide sequence	en_US
dc.subject	Biology -- Classification	en_US
dc.title	ลักษณะทางอณูชีววิทยาของยีนสไปค์และยีนนิวคลีโอแคปซิดของเชื้อไวรัสโรคท้องร่วงติดต่อในสุกร (ไวรัสพีอีดี) ที่แยกได้จากฟาร์มสุกร	en_US
dc.title.alternative	Molecular characterization of the spike and nucleocapsid genes of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) isolated from farms	en_US
dc.type	Thesis	en_US
dc.degree.name	วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต	en_US
dc.degree.level	ปริญญาโท	en_US
dc.degree.discipline	อายุรศาสตร์สัตวแพทย์	en_US
dc.degree.grantor	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.email.advisor	Supot.W@Chula.ac.th
dc.email.advisor	Pornchalit.A@Chula.ac.th
dc.email.advisor	ไม่มีข้อมูล