Abstract:
เชื้อไวรัสพี อาร์ อาร์ เอส เป็นเชื้อไวรัสที่เป็นสาเหตุของโรคพี อาร์ อาร์ เอส ในสุกร การวิจัยครั้งนี้เป็นการหาลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัสพี อาร์ อาร์ เอส สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย คือ 01NP1 เชื้อไวรัส 01NP1 นี้มีขนาด 15412 นิวคลีโอไทด์ ซึ่งประกอบด้วย 5’ UTR และ 3’ UTR (บริเวณที่ไม่มีการสร้างโปรตีน) และยีน (ORF) จำนวน 8 ยีน คือ ORF1a ORF1b และ ORF2-7 เพื่อที่จะเปรียบเทียบ ความแตกต่างของรหัสพันธุกรรมและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ของเชื้อไวรัส คณะผู้วิจัยได้เปรียบเทียบลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัสสายพันธุ์ไทยกับเชื้อไวรัสสายพันธุ์จากอเมริกา (7 ตัวอย่าง) และ ยุโรป (1 ตัวอย่าง) ผลการวิจัยพบว่าเชื้อไวรัส 01NP1 มีลำดับเบสเหมือนกับเชื้อไวรัส MLV, VR2332, และ BJ-4 เท่ากับ 99.8%, 99.7% และ 99.7% ตามลำดับ ผลการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการพบว่า เชื้อ 01NP1 มีลักษณะทางพันธุกรรมใกล้เคียงกับเชื้อไวรัส BJ-4, MLV และ VR2332 โดยสรุปอาจกล่าวได้ว่าเชื้อไวรัสสายพันธุ์ไทย (1NP1) อาจมีต้นกำเนิดและมีวิวัฒนาการมาจากเชื้อไวรัสที่ใช้เป็นวัคซีน นอกจากนี้ยังผลการเปรียบเทียบลำดับเบสพบว่าบริเวณ 5’UTR และ 3’ UTR ของเชื้อไวรัส 01NP1 มีการเปลี่ยนแปลงของลำดับเบสไม่มาก โดยบริเวณที่พบว่ามีการเปลี่ยนแปลงของกรดอะมิโนมากที่สุด คือ ORF1a การวิจัยครั้งนี้เป็นรายงานแรกในประเทศไทยที่มีการรายงานลำดับเบสทั้งหมดของเชื้อไวรัสพี อาร์ อาร์ เอส สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย
