Abstract:
ไซยาโนแบคทีเรียประเภทเอ็กซ์ทรีโมไฟล์ (extremophile) มีความสามารถในการปรับตัวเพื่อให้อยู่ในสิ่งแวดล้อมที่สุดขั้วที่ไม่เหมาะสมต่อการดำรงชีวิต ปัจจัยด้านความเค็มเป็นหนึ่งในปัญหาจากสิ่งที่ไม่มีชีวิตที่สามารถส่งผลกระทบต่อเซลล์ของไซยาโนแบคทีเรีย เมื่ออาศัยอยู่ภายในสภาพแวดล้อมที่ได้รับความเค็มในปริมาณสูงหรือได้รับเป็นเวลานานก่อให้เกิดความเครียดภายในเซลล์ได้ส่งผลให้เซลล์ต้องมีการปรับตัวเพื่อรับมือกับความเครียดเพื่อป้องกันความเสียหายที่เกิดขึ้น โดยการแสดงออกของยีนบางกลุ่มที่มีความสามารถในการควบคุมสมดุลของปฏิกริยาภายในเซลล์ให้เป็นไปตามปกติ Halothece sp. PCC7418 เป็นเอ็กซ์ทรีโมไฟล์ไซยาโนแบคทีเรียที่มีระบบ Two-Component System (TCS) ซึ่งเป็นระบบของโปรตีนที่ใช้ในการแสดงออกของเซลล์และยีนต่าง ๆ ในการตอบสนองต่อสภาพแวดล้อมภายนอกเซลล์ ประกอบด้วยโปรตีน 2 ชนิด คือ Histidine kinase (HK) เป็นการทำงานร่วมกันของ Dimerization and phosphor-acceptor (HisKA), Histidine kinase ATPase (HATPase) Response regulator (RR) ที่เป็นการทำงานของ Aspartate-containing receiver ซึ่งเมื่อ Histidine kinase ทำงานร่วมกับ Response regulator ทำให้เกิดกลุ่มของยีนที่เรียกว่า ไฮบริดไคเนส (HyK) จากการสืบค้นข้อมูลพบว่ามียีนจำนวน 13 ยีนที่คาดว่าเป็นยีนในกลุ่มนี้ ได้แก่ PCC7418_0473, PCC7418_0496, PCC7418_0613, PCC7418_0909, PCC7418_1045, PCC7418_1124, PCC7418_1191, PCC7418_1731, PCC7418_1732, PCC7418_2221, PCC7418_2725, PCC7418_2951, PCC7418_3814 ภาวะที่ใช้ในการศึกษานี้ คือ การให้ความเครียดจากความเค็มที่ความเข้มข้น NaCl 2 โมลาร์ เป็นเวลา 0, 1, 3, 6 ชั่วโมง ตรวจสอบผลการแสดงออกของยีนได้โดยการนำมาสกัด RNA และเปลี่ยนเป็น Cdnaที่ความเข้มข้น 2500 นาโนกรัม นำไปรันเจลอิเล็กโทรโฟลิซิสเพื่อตรวจสอบผลลัพธ์ที่ได้ พบว่าการแสดงออกของยีนในกลุ่มนี้มีความแตกต่างกันโดยการแสดงออกของยีนแต่ละชนิด มีค่าไม่เท่ากันจึงจำเป็นต้องทำการศึกษาต่อในอนาคตถึงปัจจัยที่เหมาะสมในการแสดงออกของยีนแต่ละตัว