การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในกลุ่ม response regulator ภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือใน Halothece sp. PCC7418

ประภาภัทร บุญทองกุล

dc.contributor.advisor	รุ่งอรุณ วาดิถี สิริศรัทธา
dc.contributor.author	ประภาภัทร บุญทองกุล
dc.contributor.other	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. คณะวิทยาศาสตร์
dc.date.accessioned	2022-06-27T02:37:17Z
dc.date.available	2022-06-27T02:37:17Z
dc.date.issued	2563
dc.identifier.uri	http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/78985
dc.description	โครงงานเป็นส่วนหนึ่งของการศึกษาตามหลักสูตรปริญญาวิทยาศาสตรบัณฑิต ภาควิชาจุลชีววิทยา คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ปีการศึกษา 2563	en_US
dc.description.abstract	ไซยาโนแบคทีเรียเป็นสิ่งมีชีวิตที่มีความสามารถในการสังเคราะห์แสง สามารถดำรงชีวิตอยู่ได้ใน สภาพแวดล้อมที่หลากหลาย แม้กระทั่งในสภาพแวดล้อมสุดขั้ว โดยหนึ่งในไซยาโนแบคทีเรียที่น่าสนใจ คือ Halothece sp. PCC7418 ที่สามารถอาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่มีความเค็มสูงได้ โดยกลไกสำคัญที่ทำให้ไซ ยาโนแบคทีเรียสามารถดำรงชีวิตในสภาพแวดล้อมที่หลากหลายได้ คือการมีระบบรับส่งสัญญาณที่เรียกว่า two component system (TCS) มีหน้าที่หลักในการตอบสนองต่อการเปลี่ยนแปลงต่อสภาพแวดล้อม ซึ่ง ระบบดังกล่าวจะประกอบด้วยโปรตีน histidine kinase (HK) ทำหน้าที่รับสัญญาณสิ่งแวดล้อม และ response regulator (RR) ทำหน้าที่ควบคุมการตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อมของเซลล์ นอกจากนี้ยังพบโปรตีน รูปแบบอื่น คือ hybrid kinases (HyK) จากการสืบค้นข้อมูลจีโนมของ Halothece sp. PCC7418 พบว่ามียีน ในกลุ่ม RR 44 ยีน โดยเลือกมาศึกษา 17 ยีน ได้แก่ PCC7418_0084, PCC7418_0225, PCC7418_0226, PCC7418_0392, PCC7418_0469, PCC7418_0612, PCC7418_0618, PCC7418_0623, PCC7418_0892, PCC7418_1006, PCC7418_1046, PCC7418_1070, PCC7418_1116, PCC7418_1120, PCC7418_1121, PCC7418_1355, และPCC7418_1501 จากนั้นนำมาวิเคราะห์การ แสดงออกของยีนภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือโซเดียมคลอไรด์ ความเข้มข้น 2.0 โมลาร์ ด้วยวิธี semiquantitative RT-PCR พบว่า ยีน PCC7418_0612, PCC7418_1070, PCC7418_0892 และ PCC7418_1355 มีระดับการแสดงออกเพิ่มขึ้น (up-regulated) อย่างมีนัยสำคัญ นอกจากนี้ยังพบว่ายีน PCC7418_1116, PCC7418_1006, PCC7418_0225 และ PCC7418_0623 มีระดับการแสดงออกลดลง (down-regulated) อย่างมีนัยสำคัญ จากผลการทดลองแสดงให้เห็นว่า RR มีหน้าที่สำคัญต่อการปรับตัวของ Halothece sp.PCC7418 ภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือ	en_US
dc.description.abstractalternative	Cyanobacteria are phototrophic organisms, which can thrive in a wide range of ecological habitats, a group of marine, freshwater, terrestrial and extreme environments. Halothece sp. PCC7418 is extremophilic cyanobacterium, which can grow under high salinity condition. One of mechanisms that enable cells to survive in the harsh condition is signaling system called two-component system (TCS) that consists of two proteins: a histidine kinase (HK) and a response regulator (RR) that function together in a phosphotransfer pathway. From the entire genome analysis of Halothece sp. PCC7418, forty-four genes of RR were found. Seventeen genes of RR, PCC7418_0084, PCC7418_0225, PCC7418_0226, PCC7418_0392, PCC7418_0469, PCC7418_0612, PCC7418_0618, PCC7418_0623, PCC7418_0892, PCC7418_1006, PCC7418_1046, PCC7418_1070, PCC7418_1116, PCC7418_1120, PCC7418_1121, PCC7418_1355, and PCC7418_1501, were utilized for gene expression analysis under salt stress. Gene expression analysis by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) showed that PCC7418_0612, PCC7418_1070, PCC7418_0892 and PCC7418_1355 were up-regulated under high salinity condition (2M NaCl). In contrary, from the study showed that PCC7418_1116, PCC7418_1006, PCC7418_0225 and PCC7418_0623 were down-regulated under high salinity condition (2M NaCl). These experimental results showed that RR is important function for the environmental adaptation of Halothece sp. PCC7418 under salt stress.	en_US
dc.language.iso	th	en_US
dc.publisher	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.rights	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US
dc.subject	ไซยาโนแบคทีเรีย -- ผลกระทบจากความเครียด	en_US
dc.subject	การแสดงออกของยีน	en_US
dc.subject	Cyanobacteria -- Effect of stress on	en_US
dc.subject	Gene expression	en_US
dc.title	การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนในกลุ่ม response regulator ภายใต้ภาวะเครียดจากเกลือใน Halothece sp. PCC7418	en_US
dc.title.alternative	Gene expression analysis of response regulator under salt stress in a cyanobacterium Halothece sp. PCC7418	en_US
dc.type	Senior Project	en_US
dc.degree.grantor	จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย	en_US