ศึกษาการจับของสารกลุ่มเพอรีลีน ไดอิไมด์กับจีควอดรูเพล็กซ์ในบริเวณโปรโมเตอร์ของยีนส์เอสอาร์เอฟ

Abstract

เอสอาร์เอฟ (SRF) เป็นหนึ่งในสมาชิกของ MADS box family ทา หน้าที่เป็นทรานสคริปชั่นแฟคเตอร์ โดยจับกับ serum response element (SRE) บนยีนหลายชนิด เช่น c-fos, fosB และ junB ซึ่งเป็น proto-oncogene โดยเอสอาร์เอฟ มีหน้าที่สาคัญในการควบคุมการเจริญเติบโตและเปลี่ยนแปลงเซลล์ จากการศึกษาวิจัยก่อนหน้าพบว่าโปรโมเตอร์ของ ยีนเอสอาร์เอฟมีลา ดับเบสกวานีนซ้า กันหลายตา แหน่ง (5’-GGGAAAGGGAAGGGAAGTTGGGGGTAGGGG-3’) สามารถเกิดโครงสร้างจีควอดรูเพล็กซ์ได้ ในงานวิจัยนี้ได้ทา การศึกษาผลของ PIPER ซึ่งเป็นสารกลุ่ม perylene diimides ต่อการเกิดโครงสร้างจีควอดรูเพล็กซ์ โดยใช้เทคนิค circular dichroism (CD) และ ultraviolet-visible spectroscopy จาก ผลการศึกษาพบว่า PIPER สามารถเหนี่ยวนาให้เกิดโครงสร้างจีควอดรูเพล็กซ์แบบ parallel ได้ แต่ในสภาวะที่มี โพแทสเซียมหรือโซเดียมไอออน PIPER จะเหนี่ยวนาให้เกิดรูปแบบของจีควอดรูเพล็กซ์แบบ parallel และ mixed parallel/antiparallel ตามลา ดับ เมื่อทา การศึกษาหาค่า melting temperature (Tm) พบว่า PIPER ช่วยให้ จีควอดรูเพล็กซ์มีความตัวทางอุณหพลศาสตร์เพิ่มขึ้น (Tm > 75 °C) นอกจากนี้ผลการทดลองด้วยวิธี UV absorption titration พบสเปกตรัมของ PIPER ที่ได้หลังการไทเทรตเกิดการเปลี่ยนแปลงอย่างชัดเจน ซึ่งเป็น หลักฐานสนับสนุนการเกิดอันตรกิริยาระหว่าง PIPER และจีควอดรูเพล็กซ์ จากผลการวิจัยสรุปได้ว่า PIPER เป็น ลิแกนด์หนึ่งที่สามารถจับและเหนี่ยวนา ให้เกิดการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างจีควอดรูเพล็กซ์ได้ พร้อมทั้งช่วยให้เกิด ความคงตัวทางอุณหพลศาสตร์มากขึ้นด้วย